Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPAP3Q9H6T3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP3Q9H6T3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms