Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms