Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6AQ9H2E6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6AQ9H2E6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms