Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39BQ9GZU3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM39BQ9GZU3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms