Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM7Q9C029 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms