Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM31Q9BZY9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms