Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP4Q9BZE4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP4Q9BZE4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms