Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SF3B5Q9BWJ5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF3B5Q9BWJ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms