Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms