Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms