Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT11Q9BT88 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms