Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERPUD2Q9BSE4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD2Q9BSE4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms