Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PYM1Q9BRP8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PYM1Q9BRP8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms