Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MESP1Q9BRJ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms