Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRQ99707 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRQ99707 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRQ99707 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRQ99707 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRQ99707 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTRQ99707 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTRQ99707 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTRQ99707 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTRQ99707 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRQ99707 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRQ99707 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRQ99707 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRQ99707 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRQ99707 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRQ99707 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRQ99707 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRQ99707 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRQ99707 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTRQ99707 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRQ99707 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRQ99707 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRQ99707 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRQ99707 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRQ99707 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRQ99707 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRQ99707 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRQ99707 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTRQ99707 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTRQ99707 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRQ99707 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRQ99707 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRQ99707 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRQ99707 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRQ99707 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRQ99707 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRQ99707 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRQ99707 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRQ99707 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms