Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LYSTQ99698 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYSTQ99698 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LYSTQ99698 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYSTQ99698 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LYSTQ99698 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LYSTQ99698 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYSTQ99698 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LYSTQ99698 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSTQ99698 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSTQ99698 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LYSTQ99698 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms