Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGMNQ99538 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms