Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF12Q96QT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms