Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP5Q96PP8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP5Q96PP8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms