Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP3Q96P20 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP3Q96P20 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms