Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS1

YPEL4, Protein yippee-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL4Q96NS1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
YPEL4Q96NS1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YPEL4Q96NS1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms