Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
YTHDC1Q96MU7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YTHDC1Q96MU7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
YTHDC1Q96MU7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms