Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC138Q96M89 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms