Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC7Q96M83 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms