Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC114Q96M63 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC114Q96M63 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms