Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf48Q96LL4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms