Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJD4Q96KN9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJD4Q96KN9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GJD4Q96KN9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GJD4Q96KN9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJD4Q96KN9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms