Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKNOX2Q96KN3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms