Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms