Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIC2Q96JB3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIC2Q96JB3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms