Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC22AQ96IW7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms