Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CMTM5Q96DZ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms