Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC124Q96CT7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC124Q96CT7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms