Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL29Q96CT2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms