Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTSSAQ969W0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms