Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3Q969G5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms