Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSR2Q969E8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms