Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT35Q92764 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT35Q92764 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT35Q92764 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT35Q92764 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT35Q92764 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT35Q92764 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT35Q92764 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms