Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3CQ92520 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3CQ92520 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3CQ92520 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3CQ92520 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3CQ92520 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM3CQ92520 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3CQ92520 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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