Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF4Q8WZA2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAPGEF4Q8WZA2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAPGEF4Q8WZA2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAPGEF4Q8WZA2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAPGEF4Q8WZA2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAPGEF4Q8WZA2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms