Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASKIN2Q8WXE0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASKIN2Q8WXE0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms