Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD4Q8WVF5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCTD4Q8WVF5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCTD4Q8WVF5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms