Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCAF4Q8WV16 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCAF4Q8WV16 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms