Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELQQ8TDG4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELQQ8TDG4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms