Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTRT1Q8TDG2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTRT1Q8TDG2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms