Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX54Q8TDD1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DDX54Q8TDD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX54Q8TDD1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms