Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA3Q8TBC4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms