Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPTSSBQ8NFR3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms