Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA4Q8NEY3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA4Q8NEY3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA4Q8NEY3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA4Q8NEY3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms