Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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